علی خمینی نوه روح‌الله خمینی ضحاک بنیانگذار نظام ضد ایرانی جمهوری اسلامی، از کشتار و قتل عام زندانیان سیاسی در دهه ۶۰ شمسی که به اعدام‌های دهه شصت شهرت دارد، دفاع کرد.
به گزارش خبرگزاری حکومتی فارس متعلق به نیروی تروریستی سپاه پاسداران، علی خمینی شامگاه سه‌شنبه ۳۱ مه، طی مراسمی در مدسه فیضیه قم، میان انقلاب چهار دهه پیش ایران و انقلاب‌های اخیر در برخی از کشورهای عربی، مقایسه کرد و گفت، دلیل تفاوت سرنوشت این دو پدیده، مدیریت روح‌الله خمینی در ایران بود.
به گزارش العربیه، نوه بنیانگذار جمهوری اسلامی اظهار داشت: «این طور نبود که وضعیت ایران در زمان تحقق انقلاب اسلامی، بهتر از کشورهای منطقه بود، چرا که در غرب، جنوب، شرق و حتی شمال کشور غائله‌هایی داشتیم و این مدیریت “امام خمینی” بود که آن غائله‌ها را مدیریت کرد و کشور رفته رفته به آرامش رسید».
او در ادامه گفته است: «امروز یک عده‌ای برای “منافقین” دل می‌سوزانند که چرا اعدام کردید؟ آنها کسانی بودند که در مقابل حکومت ایستادند و جنایاتی کردند که داعش آنها را نمی کرد. آنان رئیس جمهور، نخست وزیر و بسیاری از بزرگان کشور را ترور کردند».
علی خمینی افزود که اگر پدربزرگش «در مقابل این جنایات نرمش از خود نشان می‌داد که کشور پس از ۳۰ سال هم رنگ آرامش به خود نمی‌دید».
در ادبیات سیاسی فاشیسم مذهبی جمهوری اسلامی، به سازمان «مجاهدین خلق» مخالف عمده رژیم در ایران «منافقین» گفته می‌شود.
رضا ملک، معاون سابق وزارت اطلاعات طی یک افشاگری ویدئویی تنها آمار قتل عام زندانیان سیاسی در تابستان خونین 1367 را 33700 نفر اعلام کرده است.
رضا ملک همچنین در این افشاگری ویدئویی پرده از گورهای جمعی متعددی در اقصی نقاط ایران برداشته است.
حسین علی منتظری نیز در کتاب خاطراتی که از خود بجای گذاشته است، پرده از اسنادی بر داشته که نشان می دهد که شخص خمینی ضحاک دستور قتل عام زندانیان سیاسی در سال 1367 را صادر کرده است.
تمامیت نظام ضد ایرانی جمهوری اسلامی بر آن بوده است که با سکوت در مورد قتل عام بیش از صد هزار زندانی سیاسی در دهه 60 بدستور خمینی خون آشام، خاطرات این جنایت را از ذهن مردم پاک کند. اما طرح این موضوع از سوی علی خمینی گویای مخالفتهای گسترده ای در درون و بیرون حاکمیت بر علیه این جنایت وحشیانه تاریخی است که وی را مجبور به موضع گیری کرده است.
